Apg 4 система растений
В работе дана краткая характеристика слабо распространенной в России системы классификации покрытосеменных, представленной «группой филогении покрытосеменных» – системы APG IV. Данная система учитывает наиболее современные исследования в области генетики и сосредоточена на установлении связей «семейство – порядок». Анализ определенных консервативных участков ДНК у большого количества таксонов позволил расположить покрытосеменные в соответствии с естественными родственными связями растений, то есть выстроить филогенетическое древо APG IV. В данном исследовании проведено сравнение широко используемой в России системы Тахтаджяна и системы APG IV на примере покрытосеменных растений Сахалинской области. В качестве материала для исследования использовались 1389 образцов покрытосеменных растений, среди которых выделено 476 видов покрытосеменных, составляющих 271 род. Согласно системе Тахтаджяна, данные растения представляют 77 семейств покрытосеменных. Выявлена значительная разница в количестве порядков, в которые объединяются исследованные растения по сравниваемым системам: 57 согласно системе Тахтаджяна и 32 по APG IV. Полученные данные свидетельствуют о том, что система APG IV устанавливает больше родственных взаимосвязей между семействами, чем система Тахтаджяна.
2. Byng J.W. et al. An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG IV. Botanical Journal of the Linnean Society. 2016. № 181(1). P. 1–20.
3. Cavalier-Smith T. Deep phylogeny, ancestral groups and the four ages of life. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 2010. Vol. 365. № 1537. P. 111–132.
4. Aubert D. A formal analysis of phylogenetic terminology: towards a reconsideration of the current paradigm in systematics. Phytoneuron. 2015. № 66. P. 1–54.
5. Chase M.W. Monocot relationships: an overview. American Journal of Botany. 2004. Vol. 91. № 10. P. 1645–1655.
6. Donoghue M.J., Doyle J.A. Phylogenetic analysis of angiosperms and the relationships of the Hamamelidae. In: Crane P.R., Blackmore S. (Eds.), Evolution, Systematics and Phylogeny of the Hamamelidae. Oxford: Clarendon Press, 1989. Vol. 1. 305 p.
7. Moore M.J. et al. Phylogenetic analysis of 83 plastid genes further resolves the early diversification of eudicots. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2010. Vol. 107. № 10. P. 4623–4628.
В России и, частично, за рубежом широко распространилась и используется до сих пор система Армена Леоновича Тахтаджяна (1910–2009 гг.) [1].
Данная система перерабатывалась неоднократно, следуя за новейшими исследованиями в области ботаники. Тахтаджян стремился установить максимально однородные группы покрытосеменных с учетом их происхождения, с чем связано сравнительно большое количество выделенных им семейств.
Система «группы филогении покрытосеменных» (Angiosperm phylogeny group – APG) впервые была представлена в 1998 г. К. Бремером, М.В. Чейзом, П.Ф. Стивенсом и др., однако в России широкой известности не обрела. Данная система (рисунок) сосредоточена на уровне порядков и была несколько раз обновлена с опорой на данные последних исследований, затрагивающих вопросы филогении в пределах порядков.
Кладограмма порядков по системе APG IV [2]
Система APG основана на генетических признаках. Благодаря анализу большого количества таксонов и секвенированию семи особых участков ДНК, среди которых: нуклеарные 18S rDNA, фитохромы PHYA и PHYC, пластидные rbcL, atpB и митохондриальные atp1 и matR, стало возможным подтвердить, опровергнуть существующие представления, касающиеся взаимосвязей таксонов, или выявить новые родственные связи. Для большинства случаев справедливыми оказываются зависимости, выявленные на основании классических признаков, однако внешнее сходство при классификации по вышеуказанной системе во внимание не принимается. Например, внешне похожие представители семейств Падубовые (Aquifoliaceae) и Икациновые (Icacinacae) объединялись в один порядок – Падубоцветные Aquifoliales [1]. При этом семейство Icacinacae отождествлялось с семейством Меттениусовые (Metteniusaceae). В филогенетической системе APG IV –последняя редакция системы от 2016 г. – выделяют три самостоятельных порядка: Aquifoliales, Icacinales и Metteniusales [2].
Цель данного исследования: провести сравнительный анализ систем Тахтаджяна и APG IV на примере растений Сахалинской области.
Материалы и методы исследования
Данное исследование проводилось в период с июля 2017 г. по май 2018 г.
В качестве материала для исследования использовались 1389 образцов, представляющих 476 видов покрытосеменных, составляющих 271 род, объединенный в 77 семейств.
Для уточнения систематического положения имеющихся в наличии образцов растений использовали систему покрытосеменных Тахтаджяна [1] и систему APG IV [2].
Растения объединялись в семейства в соответствии с системой классификации Тахтаджяна [1], которая широко используется, так как включает наиболее полный список родов покрытосеменных растений. Применение системы APG на уровне распределения родов по семействам невозможно, поскольку она сосредоточена на установлении связей «семейство – порядок», поэтому сравнение этих двух классификаций проводилось на уровне порядков.
Краткая характеристика системы APG IV
Отличительной чертой системы APG стало решение ее авторов отказаться от формальных ботанических названий групп, которые по рангу стоят выше порядка, что связано с недостаточностью сведений о точном составе и родстве на таком глобальном уровне организации, поэтому порядки объединены в группы, названия которых даны на английском языке.
Филогенетическая система подразумевает использование специальных систематических категорий, которые называются грады и клады. Под кладой понимают любую монофилетическую по происхождению группу, то есть группу, включающую всех потомков единственного предка. Таким образом, все представители одной клады связаны родством определенной степени. В зависимости от степени разветвленности родственных связей крупная клада может включать в себя более мелкие.
Статус нахождения в одной граде, напротив, не гарантирует родственных взаимосвязей представителей, а лишь показывает, что эта совокупность находится на одном уровне структурной сложности. Ни клады, ни грады не имеют присвоенных ботанической номенклатурой названий, поэтому для того, чтобы не перепутать официальные и неофициальные названия тех или иных групп, принято утвержденные Кодексом таксоны записывать с прописной буквы, а грады и клады — со строчной [3].
Две наиболее крупные группы системы APG называются basal angiosperms и core angiosperms (иначе – mesangiosperms). Basal angiosperms – это группа, отделившаяся от ветви первых покрытосеменных раньше подавляющего большинства остальных. Она включает 3 порядка: Амбореллоцветные (Amborellales), Кувшинкоцветные (Nympheales) и Австробэйлиецветные (Austrobaileyales), согласно первым буквам которых эту группу называют ANA-grade [2]. Основание филогенетического древа и, соответственно, наиболее древние в эволюционном отношении представители современных покрытосеменных – порядок Амбореллоцветные (Amborellales), признанный базальной линией. К данному порядку отнесен только один вид, обитающий в Новой Каледонии, поэтому можно сделать предположения о строении предков покрытосеменных по внешнему виду Amborella, например мелкие цветки (диаметр менее 5 мм) соответствуют палеботаническим находкам.
Группа core angiosperms включает в себя основную массу семейств и видов покрытосеменных. Внутри нее выделяют следующие клады: magnoliids, monocots, eudicots; также сюда входят независимо развивавшаяся группа Хлорантоцветные (Chloranthales), не включенная в последней редакции APG в более широкую кладу, и Роголистникоцветные (Ceratophyllales), чье положение пока тоже до конца не выяснено, но, предположительно, данный порядок и eudicots – сестринские группы. Сестринскими называют группы, которые на кладограмме выходят из одного узла, то есть имеют общего предка, который не является таковым для других групп [4].
Magnoliids – следующая клада по хронологии за базальной. Предположительно, когда-то она была богата в видовом отношении и широко распространена, о чем может свидетельствовать фрагментированный ареал: тропики и субтропики континентов.
Monocots – клада, являющаяся аналогом класса Однодольные. Исследования в области молекулярной филогенетики, а также изучение морфологии пыльцевых зерен покрытосеменных привели к необходимости выделения этой клады, за чем последовало изменение названия на неформальное [5]. Было установлено, что для представителей monocots характерны 1-апертурные зерна и их производные. В рамках группы выделяют клады Спаржецветные (Asparagales), Лилиецветные (Liliales), Диоскореецветные (Dioscoreales), Панданоцветные (Pandanales), Петросавиецветные (Petrosaviales), Частухоцветные (Alismatales), Аироцветные (Acorales) и commelinids.
Клада еudicots, в свою очередь, большей частью соответствует двудольным. Впервые эта клада была распознана в 1989 г. по морфологическим признакам, а максимального признания этой группы позволили достичь исследования, проведенные по трем и более генам. Отличительной особенностью представителей клады являются пыльцевые зерна трехбороздчатого типа [6].
Деление данной группы сложнее. Первое разделение происходит на две крупные клады: basal eudicots и core eudicots. Basal eudicots включает в себя представителей наиболее ранних ветвей, а именно: Лютикоцветные (Ranunculales), Протеецветные (Proteales), Троходендроцветные (Trochodendrales) и Самшитоцветные (Buxales). К core eudicots принадлежит оставшаяся подавляющая часть таксонов. Внутри данной группы выделяют также две клады: Гуннероцветные (Gunnerales) и pentapetalae. Клада pentapetalae достаточно обширна и, по примерным подсчетам, включает около 70 % всех видов покрытосеменных. Филогенетический анализ, проведенный по 83 генам, кодирующим белки и рРНК, показал, что данная многочисленная группа разделилась в процессе развития на три клады: superrosids, superasterids и Диллениецветные (Dilleniales) [7]. Клада superrosids, в свою очередь, представлена тремя кладами: rosids, Виноградоцветные (Vitales) и Камнеломкоцветные (Saxifragales). Группа rosids дополнительно делится на fabids и malvids. Клада superasterids представлена кладами Берберидопсисоцветные (Berberidopsidales), Санталоцветные (Santalales), Гвоздикоцветные (Caryophyllales) и asterids, последняя из которых является наиболее крупной и подразделяется на campanulids и lamiids [2, 7].
Результаты исследования и их обсуждение
При сравнении систем Тахтаджяна и APG IV (табл. 1 и 2) установлены сходства и различия в распределении семейств, представляющих покрытосеменные растения Сахалинской области, по порядкам.
Представители покрытосеменных Сахалинской области, систематизированные по Тахтаджяну [1]
Источник